一般认为，强直性脊柱炎有一定的疾病自限性，部分患者到一定的阶段可以自行缓解，但是也有很多患者出现关节强直、畸形和功能障碍，生活不能自理。因此，明确影响患者的预后因素，及早发现可能提示患者预后不佳的原因，从而给予早起积极治疗，将可能改善患者预后。一般认为，本病早期出现脊柱受累、脊柱活动受限、髋关节受累、幼年发病、阳性家族史、指（趾）炎、少关节炎、对于非甾体抗炎药反应不佳、炎症指标（如ESR、CRP）水平居高不下等提示强直性脊柱炎预后不佳。肾脏、心脏及肺的淀粉样变性是否提示预后不佳尚不明确。早些年用来治疗难治性强直性脊柱炎的放射治疗，可以增加患者发生白血病的几率，增加死亡率。出现足跟痛、颈椎及胸椎活动受限、阳性家族史、携带HLA-B27基因预示患者将来会呈慢性病程。另外，受教育水平低，对疾病认识不足，没有及时准确治疗，也是影响预后的重要因素。

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